Mengisahkan Ageha Yoshinaka, seorang siswa kelas satu yang bersekolah di SMA Shira. Suatu hari, Ageha menemukan kartu telepon berwarna merah bertuliskan Psyren. Setelah penemuannya tersebut, secara tiba-tiba teman masa kecilnya yakni Sakurako Amanita justru menghilang.
Usut punya usut, hilangnya Sakurako berkaitan dengan kartu telepon Psyren tersebut. Demi mencari teman masa kecilnya, Ageha mengakses Secret Society Psyren. Sejak saat itu, Ageha terlihat dalam sebuah permainan dengan nyawa taruhannya.
Mampukah Ageha menyelamatkan Sakurako dan keluar dari permainan tersebut.